@baiyaer
一个自学生物信息学的小萌新
使用docker封装cellranger
这是一个基于R语言的解决不同系统之间R包冲突的一个包管理器,以实现类似于python中pip的功能
这是一个黑马程序员的微信小程序商城,作为练习使用
shiny交互绘制泡泡图包括下载
(施工中)一个简单的R端网页程序shiny 功能一:用于绘制热图 功能二:用于计算免疫细胞含量(CIBERSOFT方法)
通过公共数据库TCGA与ImmPort数据库分别下载肝癌患者的RNAseq数据和与免疫有关基因的表达数据。将肝癌患者的LNCRNA表达数据进行差异分析,并将LNCRNA的表达数据和ImmPort数据库下载的基因表达数据做相关性分析,两者提取交集构建风险模型,再将模型进行Lasso回归分析[5],最后得出病人的风险回归模型。之后,通过风险模型来预测患者的总生存率和死亡几率。
关于肝癌的免疫分析,主要是经过免疫浸润分析与相关性分析,得出免疫基因、免疫细胞、焦亡基因间的关系